1. DBSCAN原理
DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)聚類演算法,它是一種基於高密度連通區域的、基於密度的聚類演算法,能夠將具有足夠高密度的區域劃分為簇,並在具有雜訊的數據中發現任意形狀的簇。我們總結一下DBSCAN聚類演算法原理的基本要點:
DBSCAN演算法需要選擇一種距離度量,對於待聚類的數據集中,任意兩個點之間的距離,反映了點之間的密度,說明了點與點是否能夠聚到同一類中。由於DBSCAN演算法對高維數據定義密度很困難,所以對於二維空間中的點,可以使用歐幾里德距離來進行度量。
DBSCAN演算法需要用戶輸入2個參數:一個參數是半徑(Eps),表示以給定點P為中心的圓形鄰域的范圍;另一個參數是以點P為中心的鄰域內最少點的數量(MinPts)。如果滿足:以點P為中心、半徑為Eps的鄰域內的點的個數不少於MinPts,則稱點P為核心點。
DBSCAN聚類使用到一個k-距離的概念,k-距離是指:給定數據集P={p(i); i=0,1,…n},對於任意點P(i),計算點P(i)到集合D的子集S={p(1), p(2), …, p(i-1), p(i+1), …, p(n)}中所有點之間的距離,距離按照從小到大的順序排序,假設排序後的距離集合為D={d(1), d(2), …, d(k-1), d(k), d(k+1), …,d(n)},則d(k)就被稱為k-距離。也就是說,k-距離是點p(i)到所有點(除了p(i)點)之間距離第k近的距離。對待聚類集合中每個點p(i)都計算k-距離,最後得到所有點的k-距離集合E={e(1), e(2), …, e(n)}。
根據經驗計算半徑Eps:根據得到的所有點的k-距離集合E,對集合E進行升序排序後得到k-距離集合E』,需要擬合一條排序後的E』集合中k-距離的變化曲線圖,然後繪出曲線,通過觀察,將急劇發生變化的位置所對應的k-距離的值,確定為半徑Eps的值。
根據經驗計算最少點的數量MinPts:確定MinPts的大小,實際上也是確定k-距離中k的值,DBSCAN演算法取k=4,則MinPts=4。
另外,如果覺得經驗值聚類的結果不滿意,可以適當調整Eps和MinPts的值,經過多次迭代計算對比,選擇最合適的參數值。可以看出,如果MinPts不變,Eps取得值過大,會導致大多數點都聚到同一個簇中,Eps過小,會導致以一個簇的分裂;如果Eps不變,MinPts的值取得過大,會導致同一個簇中點被標記為雜訊點,MinPts過小,會導致發現大量的核心點。
2. 數據挖掘干貨總結(四)--聚類演算法
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聚類演算法
一 、 本質
將數據劃分到不同的類里,使相似的數據在同一類里,不相似的數據在不同類里
二 、 分類演算法用來解決什麼問題
文本聚類、圖像聚類和商品聚類,便於發現規律,以解決數據稀疏問題
三 、 聚類演算法基礎知識
1. 層次聚類 vs 非層次聚類
– 不同類之間有無包含關系
2. 硬聚類 vs 軟聚類
– 硬聚類:每個對象只屬於一個類
– 軟聚類:每個對象以某個概率屬於每個類
3. 用向量表示對象
– 每個對象用一個向量表示,可以視為高維空間的一個點
– 所有對象形成數據空間(矩陣)
– 相似度計算:Cosine、點積、質心距離
4. 用矩陣列出對象之間的距離、相似度
5. 用字典保存上述矩陣(節省空間)
D={(1,1):0,(1,2):2,(1,3):6...(5,5):0}
6. 評價方法
– 內部評價法(Internal Evalution):
• 沒有外部標准,非監督式
• 同類是否相似,跨類是否相異
DB值越小聚類效果越好,反之,越不好
– 外部評價法(External Evalution):
• 准確度(accuracy): (C11+C22) / (C11 + C12 + C21 + C22)
• 精度(Precision): C11 / (C11 + C21 )
• 召回(Recall): C11 / (C11 + C12 )
• F值(F-measure):
β表示對精度P的重視程度,越大越重視,默認設置為1,即變成了F值,F較高時則能說明聚類效果較好。
四 、 有哪些聚類演算法
主要分為 層次化聚類演算法 , 劃分式聚類演算法 , 基於密度的聚類演算法 , 基於網格的聚類演算法 , 基於模型的聚類演算法等 。
4.1 層次化聚類演算法
又稱樹聚類演算法,透過一種層次架構方式,反復將數據進行分裂或聚合。典型的有BIRCH演算法,CURE演算法,CHAMELEON演算法,Sequence data rough clustering演算法,Between groups average演算法,Furthest neighbor演算法,Neares neighbor演算法等。
凝聚型層次聚類 :
先將每個對象作為一個簇,然後合並這些原子簇為越來越大的簇,直到所有對象都在一個簇中,或者某個終結條件被滿足。
演算法流程:
1. 將每個對象看作一類,計算兩兩之間的最小距離;
2. 將距離最小的兩個類合並成一個新類;
3. 重新計算新類與所有類之間的距離;
4. 重復2、3,直到所有類最後合並成一類。
特點:
1. 演算法簡單
2. 層次用於概念聚類(生成概念、文檔層次樹)
3. 聚類對象的兩種表示法都適用
4. 處理大小不同的簇
5. 簇選取步驟在樹狀圖生成之後
4.2 劃分式聚類演算法
預先指定聚類數目或聚類中心,反復迭代逐步降低目標函數誤差值直至收斂,得到最終結果。K-means,K-modes-Huang,K-means-CP,MDS_CLUSTER, Feature weighted fuzzy clustering,CLARANS等
經典K-means:
演算法流程:
1. 隨機地選擇k個對象,每個對象初始地代表了一個簇的中心;
2. 對剩餘的每個對象,根據其與各簇中心的距離,將它賦給最近的簇;
3. 重新計算每個簇的平均值,更新為新的簇中心;
4. 不斷重復2、3,直到准則函數收斂。
特點:
1.K的選擇
2.中心點的選擇
– 隨機
– 多輪隨機:選擇最小的WCSS
3.優點
– 演算法簡單、有效
– 時間復雜度:O(nkt)
4.缺點
– 不適於處理球面數據
– 密度、大小不同的聚類,受K的限制,難於發現自然的聚類
4.3 基於模型的聚類演算法
為每簇假定了一個模型,尋找數據對給定模型的最佳擬合,同一」類「的數據屬於同一種概率分布,即假設數據是根據潛在的概率分布生成的。主要有基於統計學模型的方法和基於神經網路模型的方法,尤其以基於概率模型的方法居多。一個基於模型的演算法可能通過構建反應數據點空間分布的密度函數來定位聚類。基於模型的聚類試圖優化給定的數據和某些數據模型之間的適應性。
SOM 神經網路演算法 :
該演算法假設在輸入對象中存在一些拓撲結構或順序,可以實現從輸入空間(n維)到輸出平面(2維)的降維映射,其映射具有拓撲特徵保持性質,與實際的大腦處理有很強的理論聯系。
SOM網路包含輸入層和輸出層。輸入層對應一個高維的輸入向量,輸出層由一系列組織在2維網格上的有序節點構成,輸入節點與輸出節點通過權重向量連接。學習過程中,找到與之距離最短的輸出層單元,即獲勝單元,對其更新。同時,將鄰近區域的權值更新,使輸出節點保持輸入向量的拓撲特徵。
演算法流程:
1. 網路初始化,對輸出層每個節點權重賦初值;
2. 將輸入樣本中隨機選取輸入向量,找到與輸入向量距離最小的權重向量;
3. 定義獲勝單元,在獲勝單元的鄰近區域調整權重使其向輸入向量靠攏;
4. 提供新樣本、進行訓練;
5. 收縮鄰域半徑、減小學習率、重復,直到小於允許值,輸出聚類結果。
4.4 基於密度聚類演算法
只要鄰近區域的密度(對象或數據點的數目)超過某個閾值,就繼續聚類,擅於解決不規則形狀的聚類問題,廣泛應用於空間信息處理,SGC,GCHL,DBSCAN演算法、OPTICS演算法、DENCLUE演算法。
DBSCAN:
對於集中區域效果較好,為了發現任意形狀的簇,這類方法將簇看做是數據空間中被低密度區域分割開的稠密對象區域;一種基於高密度連通區域的基於密度的聚類方法,該演算法將具有足夠高密度的區域劃分為簇,並在具有雜訊的空間數據中發現任意形狀的簇。
4.5 基於網格的聚類演算法
基於網格的方法把對象空間量化為有限數目的單元,形成一個網格結構。所有的聚類操作都在這個網格結構(即量化空間)上進行。這種方法的主要優點是它的處理 速度很快,其處理速度獨立於數據對象的數目,只與量化空間中每一維的單元數目有關。但這種演算法效率的提高是以聚類結果的精確性為代價的。經常與基於密度的演算法結合使用。代表演算法有STING演算法、CLIQUE演算法、WAVE-CLUSTER演算法等。
3. 如何運用聚類分析法
聚類分析法是理想的多變數統計技術,主要有分層聚類法和迭代聚類法。聚類通過把目標數據放入少數相對同源的組或「類」(cluster)里。分析表達數據,(1)通過一系列的檢測將待測的一組基因的變異標准化,然後成對比較線性協方差。(2)通過把用最緊密關聯的譜來放基因進行樣本聚類,例如用簡單的層級聚類(hierarchical clustering)方法。這種聚類亦可擴展到每個實驗樣本,利用一組基因總的線性相關進行聚類。(3)多維等級分析(multidimensional scaling analysis,MDS)是一種在二維Euclidean 「距離」中顯示實驗樣本相關的大約程度。(4)K-means方法聚類,通過重復再分配類成員來使「類」內分散度最小化的方法。
聚類方法有兩個顯著的局限:首先,要聚類結果要明確就需分離度很好(well-separated)的數據。幾乎所有現存的演算法都是從互相區別的不重疊的類數據中產生同樣的聚類。但是,如果類是擴散且互相滲透,那麼每種演算法的的結果將有點不同。結果,每種演算法界定的邊界不清,每種聚類演算法得到各自的最適結果,每個數據部分將產生單一的信息。為解釋因不同演算法使同樣數據產生不同結果,必須注意判斷不同的方式。對遺傳學家來說,正確解釋來自任一演算法的聚類內容的實際結果是困難的(特別是邊界)。最終,將需要經驗可信度通過序列比較來指導聚類解釋。
第二個局限由線性相關產生。上述的所有聚類方法分析的僅是簡單的一對一的關系。因為只是成對的線性比較,大大減少發現表達類型關系的計算量,但忽視了生物系統多因素和非線性的特點。
從統計學的觀點看,聚類分析是通過數據建模簡化數據的一種方法。傳統的統計聚類分析方法包括系統聚類法、分解法、加入法、動態聚類法、有序樣品聚類、有重疊聚類和模糊聚類等。採用k-均值、k-中心點等演算法的聚類分析工具已被加入到許多著名的統計分析軟體包中,如SPSS、SAS等。
從機器學習的角度講,簇相當於隱藏模式。聚類是搜索簇的無監督學習過程。與分類不同,無監督學習不依賴預先定義的類或帶類標記的訓練實例,需要由聚類學習演算法自動確定標記,而分類學習的實例或數據對象有類別標記。聚類是觀察式學習,而不是示例式的學習。
從實際應用的角度看,聚類分析是數據挖掘的主要任務之一。就數據挖掘功能而言,聚類能夠作為一個獨立的工具獲得數據的分布狀況,觀察每一簇數據的特徵,集中對特定的聚簇集合作進一步地分析。
聚類分析還可以作為其他數據挖掘任務(如分類、關聯規則)的預處理步驟。
數據挖掘領域主要研究面向大型資料庫、數據倉庫的高效實用的聚類分析演算法。
聚類分析是數據挖掘中的一個很活躍的研究領域,並提出了許多聚類演算法。
這些演算法可以被分為劃分方法、層次方法、基於密度方法、基於網格方法和
基於模型方法。
1 劃分方法(PAM:PArtitioning method) 首先創建k個劃分,k為要創建的劃分個數;然後利用一個循環
定位技術通過將對象從一個劃分移到另一個劃分來幫助改善劃分質量。典型的劃分方法包括:
k-means,k-medoids,CLARA(Clustering LARge Application),
CLARANS(Clustering Large Application based upon RANdomized Search).
FCM
2 層次方法(hierarchical method) 創建一個層次以分解給定的數據集。該方法可以分為自上
而下(分解)和自下而上(合並)兩種操作方式。為彌補分解與合並的不足,層次合
並經常要與其它聚類方法相結合,如循環定位。典型的這類方法包括:
第一個是;BIRCH(Balanced Iterative Recing and Clustering using Hierarchies) 方法,它首先利用樹的結構對對象集進行劃分;然後再利
用其它聚類方法對這些聚類進行優化。
第二個是CURE(Clustering Using REprisentatives) 方法,它利用固定數目代表對象來表示相應聚類;然後對各聚類按照指定
量(向聚類中心)進行收縮。
第三個是ROCK方法,它利用聚類間的連接進行聚類合並。
最後一個CHEMALOEN,它則是在層次聚類時構造動態模型。
3 基於密度方法,根據密度完成對象的聚類。它根據對象周圍的密度(如
DBSCAN)不斷增長聚類。典型的基於密度方法包括:
DBSCAN(Densit-based Spatial Clustering of Application with Noise):該演算法通過不斷生長足夠高密
度區域來進行聚類;它能從含有雜訊的空間資料庫中發現任意形狀的聚類。此方法將一個聚類定義
為一組「密度連接」的點集。
OPTICS(Ordering Points To Identify the Clustering Structure):並不明確產生一
個聚類,而是為自動交互的聚類分析計算出一個增強聚類順序。。
4 基於網格方法,首先將對象空間劃分為有限個單元以構成網格結構;然後利
用網格結構完成聚類。
STING(STatistical INformation Grid) 就是一個利用網格單元保存的統計信息進行基
於網格聚類的方法。
CLIQUE(Clustering In QUEst)和Wave-Cluster 則是一個將基於網格與基於密度相結合的方
法。
5 基於模型方法,它假設每個聚類的模型並發現適合相應模型的數據。典型的
基於模型方法包括:
統計方法COBWEB:是一個常用的且簡單的增量式概念聚類方法。它的輸入對象是采
用符號量(屬性-值)對來加以描述的。採用分類樹的形式來創建
一個層次聚類。
CLASSIT是COBWEB的另一個版本.。它可以對連續取值屬性進行增量式聚
類。它為每個結點中的每個屬性保存相應的連續正態分布(均值與方差);並利
用一個改進的分類能力描述方法,即不象COBWEB那樣計算離散屬性(取值)
和而是對連續屬性求積分。但是CLASSIT方法也存在與COBWEB類似的問題。
因此它們都不適合對大資料庫進行聚類處理.
4. dbscan聚類演算法是什麼
DBSCAN是基於密度空間的聚類演算法,與KMeans演算法不同,它不需要確定聚類的數量,而是基於數據推測聚類的數目,它能夠針對任意形狀產生聚類。
DBSCAN使用的方法很簡單,它任意選擇一個沒有類別的核心對象作為種子,然後找到所有這個核心對象能夠密度可達的樣本集合,即為一個聚類簇。接著繼續選擇另一個沒有類別的核心對象去尋找密度可達的樣本集合,這樣就得到另一個聚類簇。
DBSCAN演算法需要首先確定兩個參數:
1、epsilon:在一個點周圍鄰近區域的半徑。
2、minPts:鄰近區域內至少包含點的個數。
通常根據以上兩個參數,結合epsilon-neighborhood的特徵,可以把樣本中的點分成核點、邊緣點、離群點三類。
5. 如何將dbscan演算法導入weka中
看清楚dbscan演算法中有兩個關鍵的參數是 EPS, and Min group threshold. 直觀的想法是,如果你的eps很大,min-group-threshold 也很大的時候,那你得到的聚類的類數目就會少很多,那你搜索的時候就可能很快收斂。
6. 常用的聚類方法有哪幾種
聚類分析的演算法可以分為劃分法、層次法、基於密度的方法、基於網格的方法、基於模型的方法。
1、劃分法,給定一個有N個元組或者紀錄的數據集,分裂法將構造K個分組,每一個分組就代表一個聚類,K<N。
2、層次法,這種方法對給定的數據集進行層次似的分解,直到某種條件滿足為止。
3、基於密度的方法,基於密度的方法與其它方法的一個根本區別是:它不是基於各種各樣的距離的,而是基於密度的。這樣就能克服基於距離的演算法只能發現「類圓形」的聚類的缺點。
4、圖論聚類方法解決的第一步是建立與問題相適應的圖,圖的節點對應於被分析數據的最小單元,圖的邊(或弧)對應於最小處理單元數據之間的相似性度量。
5、基於網格的方法,這種方法首先將數據空間劃分成為有限個單元的網格結構,所有的處理都是以單個的單元為對象的。
6、基於模型的方法,基於模型的方法給每一個聚類假定一個模型,然後去尋找能夠很好的滿足這個模型的數據集。
(6)dbscan演算法的輸入擴展閱讀:
在商業上,聚類可以幫助市場分析人員從消費者資料庫中區分出不同的消費群體來,並且概括出每一類消費者的消費模式或者說習慣。
它作為數據挖掘中的一個模塊,可以作為一個單獨的工具以發現資料庫中分布的一些深層的信息,並且概括出每一類的特點,或者把注意力放在某一個特定的類上以作進一步的分析;並且,聚類分析也可以作為數據挖掘演算法中其他分析演算法的一個預處理步驟。
許多聚類演算法在小於 200 個數據對象的小數據集合上工作得很好;但是,一個大規模資料庫可能包含幾百萬個對象,在這樣的大數據集合樣本上進行聚類可能會導致有偏的結果。
許多聚類演算法在聚類分析中要求用戶輸入一定的參數,例如希望產生的簇的數目。聚類結果對於輸入參數十分敏感。參數通常很難確定,特別是對於包含高維對象的數據集來說。這樣不僅加重了用戶的負擔,也使得聚類的質量難以控制。
7. 我想問一下Michal Daszykowski寫的DBSCAN演算法是否只能聚類二維數據
好像是吧。[m,n]=size(x);輸入的變數x只是個二維的。
8. dbscan演算法是什麼
DBSCAN基於高密度連通區域的、基於密度的聚類演算法,能夠將具有足夠高密度的區域劃分為簇,並在具有雜訊的數據中發現任意形狀的簇。我們總結一下DBSCAN聚類演算法原理的基本要點:
DBSCAN演算法需要選擇一種距離度量,對於待聚類的數據集中,任意兩個點之間的距離,反映了點之間的密度,說明了點與點是否能夠聚到同一類中。由於DBSCAN演算法對高維數據定義密度很困難,所以對於二維空間中的點,可以使用歐幾里德距離來進行度量。
(8)dbscan演算法的輸入擴展閱讀:
dbscan個聚類以便使得所獲得的聚類滿足:同一聚類中的對象相似度較高;而不同聚類中的對象相似度較小。聚類相似度是利用各聚類中對象的均值所獲得一個「中心對象」(引力中心)來進行計算的。
(1)適當選擇c個類的初始中心;
(2)在第k次迭代中,對任意一個樣本,求其到c個中心的距離,將該樣本歸到距離最短的中心所在的類;
(3)利用均值等方法更新該類的中心值;
(4)對於所有的c個聚類中心,如果利用(2)(3)的迭代法更新後,值保持不變,則迭代結束,否則繼續迭代。
9. DBSCAN原理和演算法偽代碼,與kmeans,OPTICS區別
DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)聚類演算法,它是一種基於高密度連通區域的、基於密度的聚類演算法,能夠將具有足夠高密度的區域劃分為簇,並在具有雜訊的數據中發現任意形狀的簇。我們總結一下DBSCAN聚類演算法原理的基本要點:
DBSCAN演算法需要選擇一種距離度量,對於待聚類的數據集中,任意兩個點之間的距離,反映了點之間的密度,說明了點與點是否能夠聚到同一類中。由於DBSCAN演算法對高維數據定義密度很困難,所以對於二維空間中的點,可以使用歐幾里德距離來進行度量。
DBSCAN演算法需要用戶輸入2個參數:一個參數是半徑(Eps),表示以給定點P為中心的圓形鄰域的范圍;另一個參數是以點P為中心的鄰域內最少點的數量(MinPts)。如果滿足:以點P為中心、半徑為Eps的鄰域內的點的個數不少於MinPts,則稱點P為核心點。
DBSCAN聚類使用到一個k-距離的概念,k-距離是指:給定數據集P={p(i); i=0,1,…n},對於任意點P(i),計算點P(i)到集合D的子集S={p(1), p(2), …, p(i-1), p(i+1), …, p(n)}中所有點之間的距離,距離按照從小到大的順序排序,假設排序後的距離集合為D={d(1), d(2), …, d(k-1), d(k), d(k+1), …,d(n)},則d(k)就被稱為k-距離。也就是說,k-距離是點p(i)到所有點(除了p(i)點)之間距離第k近的距離。對待聚類集合中每個點p(i)都計算k-距離,最後得到所有點的k-距離集合E={e(1), e(2), …, e(n)}。
根據經驗計算半徑Eps:根據得到的所有點的k-距離集合E,對集合E進行升序排序後得到k-距離集合E』,需要擬合一條排序後的E』集合中k-距離的變化曲線圖,然後繪出曲線,通過觀察,將急劇發生變化的位置所對應的k-距離的值,確定為半徑Eps的值。
根據經驗計算最少點的數量MinPts:確定MinPts的大小,實際上也是確定k-距離中k的值,DBSCAN演算法取k=4,則MinPts=4。
另外,如果覺得經驗值聚類的結果不滿意,可以適當調整Eps和MinPts的值,經過多次迭代計算對比,選擇最合適的參數值。可以看出,如果MinPts不變,Eps取得值過大,會導致大多數點都聚到同一個簇中,Eps過小,會導致已一個簇的分裂;如果Eps不變,MinPts的值取得過大,會導致同一個簇中點被標記為雜訊點,MinPts過小,會導致發現大量的核心點。
我們需要知道的是,DBSCAN演算法,需要輸入2個參數,這兩個參數的計算都來自經驗知識。半徑Eps的計算依賴於計算k-距離,DBSCAN取k=4,也就是設置MinPts=4,然後需要根據k-距離曲線,根據經驗觀察找到合適的半徑Eps的值,下面的演算法實現過程中,我們會詳細說明。對於演算法的實現,首先我們概要地描述一下實現的過程:
1)解析樣本數據文件。2)計算每個點與其他所有點之間的歐幾里德距離。3)計算每個點的k-距離值,並對所有點的k-距離集合進行升序排序,輸出的排序後的k-距離值。4)將所有點的k-距離值,在Excel中用散點圖顯示k-距離變化趨勢。5)根據散點圖確定半徑Eps的值。)根據給定MinPts=4,以及半徑Eps的值,計算所有核心點,並建立核心點與到核心點距離小於半徑Eps的點的映射。7)根據得到的核心點集合,以及半徑Eps的值,計算能夠連通的核心點,得到雜訊點。8)將能夠連通的每一組核心點,以及到核心點距離小於半徑Eps的點,都放到一起,形成一個簇。9)選擇不同的半徑Eps,使用DBSCAN演算法聚類得到的一組簇及其雜訊點,使用散點圖對比聚類效果。
演算法偽代碼:
演算法描述:
演算法:DBSCAN
輸入:E——半徑
MinPts——給定點在E鄰域內成為核心對象的最小鄰域點數。
D——集合。
輸出:目標類簇集合
方法:Repeat
1)判斷輸入點是否為核心對象
2)找出核心對象的E鄰域中的所有直接密度可達點。
Until 所有輸入點都判斷完畢。
Repeat
針對所有核心對象的E鄰域內所有直接密度可達點找到最大密度相連對象集合,中間涉及到一些密度可達對象的合並。Until 所有核心對象的E領域都遍歷完畢
DBSCAN和Kmeans的區別:
1)K均值和DBSCAN都是將每個對象指派到單個簇的劃分聚類演算法,但是K均值一般聚類所有對象,而DBSCAN丟棄被它識別為雜訊的對象。
2)K均值使用簇的基於原型的概念,而DBSCAN使用基於密度的概念。
3)K均值很難處理非球形的簇和不同大小的簇。DBSCAN可以處理不同大小或形狀的簇,並且不太受雜訊和離群點的影響。當簇具有很不相同的密度時,兩種演算法的性能都很差。
4)K均值只能用於具有明確定義的質心(比如均值或中位數)的數據。DBSCAN要求密度定義(基於傳統的歐幾里得密度概念)對於數據是有意義的。
5)K均值可以用於稀疏的高維數據,如文檔數據。DBSCAN通常在這類數據上的性能很差,因為對於高維數據,傳統的歐幾里得密度定義不能很好處理它們。
6)K均值和DBSCAN的最初版本都是針對歐幾里得數據設計的,但是它們都被擴展,以便處理其他類型的數據。
7)基本K均值演算法等價於一種統計聚類方法(混合模型),假定所有的簇都來自球形高斯分布,具有不同的均值,但具有相同的協方差矩陣。DBSCAN不對數據的分布做任何假定。
8)K均值DBSCAN和都尋找使用所有屬性的簇,即它們都不尋找可能只涉及某個屬性子集的簇。
9)K均值可以發現不是明顯分離的簇,即便簇有重疊也可以發現,但是DBSCAN會合並有重疊的簇。
10)K均值演算法的時間復雜度是O(m),而DBSCAN的時間復雜度是O(m^2),除非用於諸如低維歐幾里得數據這樣的特殊情況。
11)DBSCAN多次運行產生相同的結果,而K均值通常使用隨機初始化質心,不會產生相同的結果。
12)DBSCAN自動地確定簇個數,對於K均值,簇個數需要作為參數指定。然而,DBSCAN必須指定另外兩個參數:Eps(鄰域半徑)和MinPts(最少點數)。
13)K均值聚類可以看作優化問題,即最小化每個點到最近質心的誤差平方和,並且可以看作一種統計聚類(混合模型)的特例。DBSCAN不基於任何形式化模型。
DBSCAN與OPTICS的區別:
DBSCAN演算法,有兩個初始參數E(鄰域半徑)和minPts(E鄰域最小點數)需要用戶手動設置輸入,並且聚類的類簇結果對這兩個參數的取值非常敏感,不同的取值將產生不同的聚類結果,其實這也是大多數其他需要初始化參數聚類演算法的弊端。
為了克服DBSCAN演算法這一缺點,提出了OPTICS演算法(Ordering Points to identify the clustering structure)。OPTICS並 不顯示的產生結果類簇,而是為聚類分析生成一個增廣的簇排序(比如,以可達距離為縱軸,樣本點輸出次序為橫軸的坐標圖),這個排序代表了各樣本點基於密度 的聚類結構。它包含的信息等價於從一個廣泛的參數設置所獲得的基於密度的聚類,換句話說,從這個排序中可以得到基於任何參數E和minPts的DBSCAN演算法的聚類結果。
OPTICS兩個概念:
核心距離:對象p的核心距離是指是p成為核心對象的最小E』。如果p不是核心對象,那麼p的核心距離沒有任何意義。
可達距離:對象q到對象p的可達距離是指p的核心距離和p與q之間歐幾里得距離之間的較大值。如果p不是核心對象,p和q之間的可達距離沒有意義。
演算法描述:OPTICS演算法額外存儲了每個對象的核心距離和可達距離。基於OPTICS產生的排序信息來提取類簇。
10. dbscan聚類演算法是什麼
dbscan聚類演算法是基於密度的聚類演算法,與劃分和層次聚類方法不同,它將簇定義為密度相連的點的最大集合,能夠把具有足夠高密度的區域劃分為簇,並可在雜訊的空間資料庫中發現任意形狀的聚類。
對於樣本集合D,如果樣本點q在p的Ε鄰域內,並且p為核心對象,那麼對象q從對象p直接密度可達。
聚類演算法的應用
DBScan需要二個參數掃描半徑 和最小包含點數。 任選一個未被訪問的點開始,找出與其距離在eps之內的所有附近點。如果附近點的數量≥minPts,則當前點與其附近點形成一個簇,並且出發點被標記為已訪問。
然後遞歸,以相同的方法處理該簇內所有未被標記為已訪問的點,從而對簇進行擴展。附近點的數量<minPts,則該點暫時被標記作為雜訊點。如果簇充分地被擴展,即簇內的所有點被標記為已訪問,然後用同樣的演算法去處理未被訪問的點檢測資料庫中尚未檢查過的對象p。
如果p未被處理歸為某個簇或者標記為雜訊,則檢查其鄰域,若包含的對象數不小於minPts,建立新簇C,將其中的所有點加入候選集N;對候選集N中所有尚未被處理的對象q,檢查其鄰域,若至少包含minPts個對象,則將這些對象加入N;如果q未歸入任何一個簇,則將q加入C。