R讀取文件命令

⑴ r，w，x三個許可權對於文件和目錄分別代表什麼意思

r w x代表的意思不用多說。
但這個概念對目錄與文件是不同的。
文件：r 能讀文件內容 w 能修改文件內容，但不一定能刪除該文件，要看你對文件目錄的許可權 x 能讓系統執行該文件，無論文件是什麼類型，只要有x許可權就可以執行

目錄：r 能讀文件清單內容，能讀到目錄下有那些文件，想想ls命令。GUI模式也能進入該目錄查看 w 能修改目錄內容，簡單的講能刪除、新建目錄或文件 x 理解有點困難，指能切換至該目錄成為工作環境，怎麼理解了，你想想cd命令就大概清楚了。但此時能不能做什麼事情要看你的w許可權是否有。

⑵ 如何才能拿R讀取Excel文件

R語言讀取excel文件文件其實有很多的包可以做到，最常用的就是xlsx和readxl, 首先，安裝並載入讀取excel文件所用的包：
install.packages("xlsx") library(xlsx)

或者，
install.packages("readxl") library(readxl)

兩個包的基本介紹
xlsx是用R把excel文件中的工作表以data.frame的格式讀入R語言，他有兩個常用函數，其中read.xlsx2通常會比read.xlsx讀取的速度更快一些，因為它的好多工作是利用Java完成的，所以速度有所提升，但是在讀取子數據集的時候沒有read.xlsx穩定性好。
read.xlsx(file, sheetIndex, sheetName=NULL, rowIndex=NULL, startRow=NULL, endRow=NULL, colIndex=NULL, as.data.frame=TRUE, header=TRUE, colClasses=NA, keepFormulas=FALSE, encoding="unknown", ...)
read.xlsx2(file, sheetIndex, sheetName=NULL, startRow=1, colIndex=NULL, endRow=NULL, as.data.frame=TRUE, header=TRUE, colClasses="character", ...)
註：
sheetIndex:工作表單號
rowIndex:行號，就是你想讀取那些行
header:表頭，就是有沒有列名。比如姓名，年齡，學號等
startRow:比如你想從第五行開始讀取，就設置startRow = 5
readxl包可以用來讀取xls和xlsx格式的文件
read_excel(path, sheet = 1, col_names = TRUE, col_types = NULL, na = "", skip = 0)
註：
sheet：讀取的工作表
col_names: 如果是FALSE的話，就表示第一行不是列名，R會自動給你取成x1,x2...
colt_types: blank,numeric,date,text
na: 缺失值，默認空著的單元是缺失值，你也可以自己指定，比如認為999是缺失值

⑶ 怎樣在r中直接讀取excel文件

由於Excel文件都是通過DDE的方式打開的，如果在選項中設置了「忽略其他應用程序」，則Excel會忽略掉其他應用程序的DDE請求，所以當你通過資源瀏覽器來打開Excel文件時，Excel並不會執行打開命令。恢復設置的方法是：
1、在Excel2003中雙擊不能打開文件：

打開「工具」-「選項」-「常規」-「設置」，看到「忽略其他應用程序」前打了勾，取消這個選擇，按「確定」，關閉Excel，雙擊Excel文件，順利打開。
2、在Excel2007及以上版本中雙擊不能打開文件：
點擊Excel 2007 菜單，選擇Excel選項--高級---常規, 把「忽略使用動態數據交換(DDE)的其他應用程序」此處的勾去掉，關閉Excel，雙擊Excel文件，順利打開。
附：DDE簡要說明

DDE就是「動態數據傳輸」，主要用在兩個EXE程序之間傳送數據。

比如：a.exe運行過程中要調用b.exe程序，但要告訴B從哪裡開始運行，B從A處得到數據，再判斷數據，就知道怎麼運行了。

⑷ 在r語言中用什麼命令讀取全部數據

使用R語言的時候，如果是少量數據，不妨使用c()或其他函數進行創建；但是對於大量數據，最好還是先通過其他更方便的軟體創建數據文件，然後使用R讀入這個文件。
.csv是非常好的數據文件格式，跨平台支持非常好。我在Excel或者SPSS中創建的數據，只要存為csv格式，就可以使用幾乎任何數據處理軟體對這些數據進行處理了。使用通用格式在多人合作、不同版本兼容等常見行為中，優勢十分明顯。另外，之所以使用不同的數據處理軟體，第一，可以取長補短。比如有些工作SPSS很復雜的，可以用R語言幾行命令搞定。第二，可以進行軟體間處理結果對照，發現問題。
R語言中讀取外部文件的最基本函數是read.table()，還有用來讀csv的read.csv()， .csv是非常好的數據文件格式，跨平台支持非常好。。
輸入help（read.table）命令，就看到了關於數據輸入函數的說明。

⑸ 如何用R讀取數據

在R語言裡面，有很多讀取數據的方法。R能讀文本文件，csv格式文件，通過RODBC包讀取資料庫數據等等。下面我介紹幾種最基本的讀取數據的方法！

工具/原料
RStudio
方法
不管是讀取數據還是寫入，R都是在工作路徑中完成的。所以首先我們要知道我們的R所在的工作路徑是在哪裡。使用getwd()函數來獲取我們的工作路徑。

下面查看工作路徑裡面有哪些文件，使用dir()函數

如果你所想導入的數據並不在你當前的工作路徑中，有兩種方法可以解決。第一種就是把數據文件放到工作路徑中，第二種方法就是更改工作路徑。更改工作路徑使用setwd()函數。比如你想要把工作路徑設置成桌面

現在我讀取我工作路徑中，名字為hw1_data.csv的文件。使用read.csv()函數

也可以使用read.table()函數來讀取csv格式的文件。由於csv文件的分隔符是「，」所以我們在用read.table()函數的時候，sep參數，我們要設定為sep=「，」

發現read.table()讀出來的數據，列名並不是我們文件中的列名，而是V1，V2。。。我們需要加上header這個參數來修改這個問題

另外在read.table()函數族中還有很多參數，對我們讀取數據都有幫助，大家可以去了解下。使用？read.table()進行了解

⑹ 如何利用r語言進行讀取數據文件，並繪制散點圖

首先，下載並安裝好R軟體。打開R軟體，可以看到R軟體主窗口。

2
為了方便編輯代碼，一般不在主窗口直接輸入程序。我們可以點擊「文件——新建程序腳本」，出現R編輯器。我們將在此輸入需要運行的命令。

3
使用因子格式輸入數據。這里輸入兩組數據，以便後面說明詳細使用方法。

4
輸入命令plot(x)，表示繪制序列x的散點圖。選中程序，右鍵，點擊「運行當前行或選中代碼」，運行程序。按F5鍵或者Ctrl+R鍵也可以實現。在圖標顯示框出現散點圖了。

5
輸入命令plot(x,y)，其中x表示自變數，y是因變數,生成y關於x的散點圖。運行命令，即出現散點圖。

6
再增加一組數據，用coplot函數繪制多變數的散點圖。coplot(x~m|y)表示在不同的y值下，x關於m的散點圖。

⑺ R中讀取文本文檔行數據的命令是

先讀進去比如：data=read.table(fileName,header=T),
然後直接用data[1]和data[3]就可以分別渠道地1列，第三列。如果想要同時取出這兩列可以用data[c(1,3)]，也可以取出來之後再和並cbind(data[1],data[3]).
這些只是我自己想的，都能實現但不一定是
最佳方案
。。

⑻ r語言怎麼讀取txt文件

1、r語言讀取txt文件的方法：首先根據下圖圖片中的命令代碼進行輸入

⑼ R語言怎麼根據輸入讀取指定文件

setwd("D://data")
function(i){
path<-paste(i,".csv",sep="")
data<-read.csv(path,header=TRUE)

}

這樣不知道行不行？希望對你有幫助。

⑽ r語言如何讀取otu豐度表

qiime2會直接給出各個分類水平的豐度表，用R語言也可以從otu表中抽提出各個水平的豐度表。
讀取otu豐富度
代碼思路：
1 strsplit後，phylum不是na也不是""則記下，否則記行數到delete
2 添加phylum列，刪除注釋列和記到delete的phylum
3 按Phylum排序，獲取Phylum unique列表
4提取第一個phylum所有行到新表，apply列求和
5遍歷剩下的phylum列表，提取每個phylum，apply按列求和，添加到新表
6 數據歸一化，保存
拓展:
R語言讀取Excel文件的各種方法

最近初學R語言，在R語言讀入EXCEL數據格式文件的問題上遇到了困難，經過在網上搜索解決了這一問題，下面歸納幾種方法，供大家分享：

第一： R中讀取excel文件中的數據的路徑：

假定在您的電腦有一個 excel 文件，原始的文件路徑是： D:workdata1

如果直接把這個路徑拷貝到R中，就會出現錯誤，原因是：

是escape character（轉義符），\才是真正的字元，或者用/

因此，在R中有兩種方法讀取該路徑：

1：在R中輸入一下路徑： D:\work\data\1 2：在R中輸入一下路徑： D:\work\data\1 第二： R中讀取excel文件中的數據的方法 ：

read.table(),read.csv(),read.delim()直接讀取EXCEl文件時，都會遇到一下問題：「在讀取『.xls』的TableHeader時遇到不完全的最後一行」。解決的方法有以下幾種：假如文件1.1中是一個6乘以2的矩陣，元素為：

方法1： xls另存為csv格式然後用read.csv ：

具體過程如下：

> data<-read.csv("D:\work\data\1.csv") > data X1 X23 1 2 24 2 3 25 3 4 26 4 5 27 5 6 28 > data<-read.csv("D:\work\data\1.csv",header = F) > data V1 V2 1 1 23333 2 2 24 3 3 25 4 4 26 5 5 27 6 6 28 > data<-read.csv("D:\work\data\1.csv",header = T) > data X1 X23333 1 2 24 2 3 25 3 4 26 4 5 27 5 6 28 也就是說 header = T（TURE）是默認的狀態 ，在這默認狀態下，輸出的data矩陣是一個5乘以2的矩陣，第一行作為了data的名字，如果 header = F（FALSE）， 則會現實原始的矩陣結果。

方法2： xls另存為txt格式然後用read.table ： 如例子所示：

> data<-read.table("D:\work\data\1.txt",header = T) > data X1 X23 1 2 24 2 3 25 3 4 26 4 5 27 5 6 28

> data<-read.table("D:\work\data\1.txt",header = F) > data V1 V2 1 1 23 2 2 24 3 3 25 4 4 26 5 5 27 6 6 28 方法3：打開EXCEL，全選裡面的內容，點擊復制，然後在R中輸入一下命令：數據分析培訓

data <- read.table("clipboard", header = T, sep = 't') 結果如下所示：

> data <- read.table("clipboard", header = T, sep = 't') > data X1 X23 1 2 24 2 3 25 3 4 26 4 5 27 5 6 28 > data <- read.table("clipboard", header = F, sep = 't') > data V1 V2 1 1 23 2 2 24 3 3 25 4 4 26 5 5 27 6 6 28 使用這種方法的時候一定要注意復制！剪切板裡面沒有內容是無法運行的！