R读取文件命令

⑴ r，w，x三个权限对于文件和目录分别代表什么意思

r w x代表的意思不用多说。
但这个概念对目录与文件是不同的。
文件：r 能读文件内容 w 能修改文件内容，但不一定能删除该文件，要看你对文件目录的权限 x 能让系统执行该文件，无论文件是什么类型，只要有x权限就可以执行

目录：r 能读文件清单内容，能读到目录下有那些文件，想想ls命令。GUI模式也能进入该目录查看 w 能修改目录内容，简单的讲能删除、新建目录或文件 x 理解有点困难，指能切换至该目录成为工作环境，怎么理解了，你想想cd命令就大概清楚了。但此时能不能做什么事情要看你的w权限是否有。

⑵ 如何才能拿R读取Excel文件

R语言读取excel文件文件其实有很多的包可以做到，最常用的就是xlsx和readxl, 首先，安装并载入读取excel文件所用的包：
install.packages("xlsx") library(xlsx)

或者，
install.packages("readxl") library(readxl)

两个包的基本介绍
xlsx是用R把excel文件中的工作表以data.frame的格式读入R语言，他有两个常用函数，其中read.xlsx2通常会比read.xlsx读取的速度更快一些，因为它的好多工作是利用Java完成的，所以速度有所提升，但是在读取子数据集的时候没有read.xlsx稳定性好。
read.xlsx(file, sheetIndex, sheetName=NULL, rowIndex=NULL, startRow=NULL, endRow=NULL, colIndex=NULL, as.data.frame=TRUE, header=TRUE, colClasses=NA, keepFormulas=FALSE, encoding="unknown", ...)
read.xlsx2(file, sheetIndex, sheetName=NULL, startRow=1, colIndex=NULL, endRow=NULL, as.data.frame=TRUE, header=TRUE, colClasses="character", ...)
注：
sheetIndex:工作表单号
rowIndex:行号，就是你想读取那些行
header:表头，就是有没有列名。比如姓名，年龄，学号等
startRow:比如你想从第五行开始读取，就设置startRow = 5
readxl包可以用来读取xls和xlsx格式的文件
read_excel(path, sheet = 1, col_names = TRUE, col_types = NULL, na = "", skip = 0)
注：
sheet：读取的工作表
col_names: 如果是FALSE的话，就表示第一行不是列名，R会自动给你取成x1,x2...
colt_types: blank,numeric,date,text
na: 缺失值，默认空着的单元是缺失值，你也可以自己指定，比如认为999是缺失值

⑶ 怎样在r中直接读取excel文件

由于Excel文件都是通过DDE的方式打开的，如果在选项中设置了“忽略其他应用程序”，则Excel会忽略掉其他应用程序的DDE请求，所以当你通过资源浏览器来打开Excel文件时，Excel并不会执行打开命令。恢复设置的方法是：
1、在Excel2003中双击不能打开文件：

打开“工具”-“选项”-“常规”-“设置”，看到“忽略其他应用程序”前打了勾，取消这个选择，按“确定”，关闭Excel，双击Excel文件，顺利打开。
2、在Excel2007及以上版本中双击不能打开文件：
点击Excel 2007 菜单，选择Excel选项--高级---常规, 把“忽略使用动态数据交换(DDE)的其他应用程序”此处的勾去掉，关闭Excel，双击Excel文件，顺利打开。
附：DDE简要说明

DDE就是“动态数据传输”，主要用在两个EXE程序之间传送数据。

比如：a.exe运行过程中要调用b.exe程序，但要告诉B从哪里开始运行，B从A处得到数据，再判断数据，就知道怎么运行了。

⑷ 在r语言中用什么命令读取全部数据

使用R语言的时候，如果是少量数据，不妨使用c()或其他函数进行创建；但是对于大量数据，最好还是先通过其他更方便的软件创建数据文件，然后使用R读入这个文件。
.csv是非常好的数据文件格式，跨平台支持非常好。我在Excel或者SPSS中创建的数据，只要存为csv格式，就可以使用几乎任何数据处理软件对这些数据进行处理了。使用通用格式在多人合作、不同版本兼容等常见行为中，优势十分明显。另外，之所以使用不同的数据处理软件，第一，可以取长补短。比如有些工作SPSS很复杂的，可以用R语言几行命令搞定。第二，可以进行软件间处理结果对照，发现问题。
R语言中读取外部文件的最基本函数是read.table()，还有用来读csv的read.csv()， .csv是非常好的数据文件格式，跨平台支持非常好。。
输入help（read.table）命令，就看到了关于数据输入函数的说明。

⑸ 如何用R读取数据

在R语言里面，有很多读取数据的方法。R能读文本文件，csv格式文件，通过RODBC包读取数据库数据等等。下面我介绍几种最基本的读取数据的方法！

工具/原料
RStudio
方法
不管是读取数据还是写入，R都是在工作路径中完成的。所以首先我们要知道我们的R所在的工作路径是在哪里。使用getwd()函数来获取我们的工作路径。

下面查看工作路径里面有哪些文件，使用dir()函数

如果你所想导入的数据并不在你当前的工作路径中，有两种方法可以解决。第一种就是把数据文件放到工作路径中，第二种方法就是更改工作路径。更改工作路径使用setwd()函数。比如你想要把工作路径设置成桌面

现在我读取我工作路径中，名字为hw1_data.csv的文件。使用read.csv()函数

也可以使用read.table()函数来读取csv格式的文件。由于csv文件的分隔符是“，”所以我们在用read.table()函数的时候，sep参数，我们要设定为sep=“，”

发现read.table()读出来的数据，列名并不是我们文件中的列名，而是V1，V2。。。我们需要加上header这个参数来修改这个问题

另外在read.table()函数族中还有很多参数，对我们读取数据都有帮助，大家可以去了解下。使用？read.table()进行了解

⑹ 如何利用r语言进行读取数据文件，并绘制散点图

首先，下载并安装好R软件。打开R软件，可以看到R软件主窗口。

2
为了方便编辑代码，一般不在主窗口直接输入程序。我们可以点击“文件——新建程序脚本”，出现R编辑器。我们将在此输入需要运行的命令。

3
使用因子格式输入数据。这里输入两组数据，以便后面说明详细使用方法。

4
输入命令plot(x)，表示绘制序列x的散点图。选中程序，右键，点击“运行当前行或选中代码”，运行程序。按F5键或者Ctrl+R键也可以实现。在图标显示框出现散点图了。

5
输入命令plot(x,y)，其中x表示自变量，y是因变量,生成y关于x的散点图。运行命令，即出现散点图。

6
再增加一组数据，用coplot函数绘制多变量的散点图。coplot(x~m|y)表示在不同的y值下，x关于m的散点图。

⑺ R中读取文本文档行数据的命令是

先读进去比如：data=read.table(fileName,header=T),
然后直接用data[1]和data[3]就可以分别渠道地1列，第三列。如果想要同时取出这两列可以用data[c(1,3)]，也可以取出来之后再和并cbind(data[1],data[3]).
这些只是我自己想的，都能实现但不一定是
最佳方案
。。

⑻ r语言怎么读取txt文件

1、r语言读取txt文件的方法：首先根据下图图片中的命令代码进行输入

⑼ R语言怎么根据输入读取指定文件

setwd("D://data")
function(i){
path<-paste(i,".csv",sep="")
data<-read.csv(path,header=TRUE)

}

这样不知道行不行？希望对你有帮助。

⑽ r语言如何读取otu丰度表

qiime2会直接给出各个分类水平的丰度表，用R语言也可以从otu表中抽提出各个水平的丰度表。
读取otu丰富度
代码思路：
1 strsplit后，phylum不是na也不是""则记下，否则记行数到delete
2 添加phylum列，删除注释列和记到delete的phylum
3 按Phylum排序，获取Phylum unique列表
4提取第一个phylum所有行到新表，apply列求和
5遍历剩下的phylum列表，提取每个phylum，apply按列求和，添加到新表
6 数据归一化，保存
拓展:
R语言读取Excel文件的各种方法

最近初学R语言，在R语言读入EXCEL数据格式文件的问题上遇到了困难，经过在网上搜索解决了这一问题，下面归纳几种方法，供大家分享：

第一： R中读取excel文件中的数据的路径：

假定在您的电脑有一个 excel 文件，原始的文件路径是： D:workdata1

如果直接把这个路径拷贝到R中，就会出现错误，原因是：

是escape character（转义符），\才是真正的字符，或者用/

因此，在R中有两种方法读取该路径：

1：在R中输入一下路径： D:\work\data\1 2：在R中输入一下路径： D:\work\data\1 第二： R中读取excel文件中的数据的方法 ：

read.table(),read.csv(),read.delim()直接读取EXCEl文件时，都会遇到一下问题：“在读取‘.xls’的TableHeader时遇到不完全的最后一行”。解决的方法有以下几种：假如文件1.1中是一个6乘以2的矩阵，元素为：

方法1： xls另存为csv格式然后用read.csv ：

具体过程如下：

> data<-read.csv("D:\work\data\1.csv") > data X1 X23 1 2 24 2 3 25 3 4 26 4 5 27 5 6 28 > data<-read.csv("D:\work\data\1.csv",header = F) > data V1 V2 1 1 23333 2 2 24 3 3 25 4 4 26 5 5 27 6 6 28 > data<-read.csv("D:\work\data\1.csv",header = T) > data X1 X23333 1 2 24 2 3 25 3 4 26 4 5 27 5 6 28 也就是说 header = T（TURE）是默认的状态 ，在这默认状态下，输出的data矩阵是一个5乘以2的矩阵，第一行作为了data的名字，如果 header = F（FALSE）， 则会现实原始的矩阵结果。

方法2： xls另存为txt格式然后用read.table ： 如例子所示：

> data<-read.table("D:\work\data\1.txt",header = T) > data X1 X23 1 2 24 2 3 25 3 4 26 4 5 27 5 6 28

> data<-read.table("D:\work\data\1.txt",header = F) > data V1 V2 1 1 23 2 2 24 3 3 25 4 4 26 5 5 27 6 6 28 方法3：打开EXCEL，全选里面的内容，点击复制，然后在R中输入一下命令：数据分析培训

data <- read.table("clipboard", header = T, sep = 't') 结果如下所示：

> data <- read.table("clipboard", header = T, sep = 't') > data X1 X23 1 2 24 2 3 25 3 4 26 4 5 27 5 6 28 > data <- read.table("clipboard", header = F, sep = 't') > data V1 V2 1 1 23 2 2 24 3 3 25 4 4 26 5 5 27 6 6 28 使用这种方法的时候一定要注意复制！剪切板里面没有内容是无法运行的！